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书书书  /G21 /G22 /G23 /G24 /G25 /G26 /G27 /G28 /G29 /G2A /G2B /G2C /G2B /G2D /G2E /G2F /G30 /G31 犛 犖/犜3 8 4 1—2 0 1 4 /G28 /G32 /G33 /G34 /G21 /G35 /G36 /G37 /G38 /G26 /G39 /G3A /G37 /G38 /G3B /G3C /G3D /G2B /G3E  /G3F /G40 /G41 /G42 /G43 /G44 /G45 /G46 /G47 /G48 /G49 /G4A(犚 犜  犔 犃犕犘 ) /G4B 犚 犪狆犻 犱犱 犲 狋 犲 犮 狋 犻 狅 狀狅 犳狀 狅 狉 狅 狏 犻 狉 狌 狊犪 狀 犱犪 狊 狋 狉 狅 狏 犻 狉 狌 狊 犻 狀狊 犺 犲 犾 犾 犳 犻 狊 犺犳 狅 狉犲 狓 狆狅 狉 狋—犚 犲 狏 犲 狉 狊 犲狋 狉 犪 狀 狊 犮 狉 犻 狆狋 犻 狅 狀  犾 狅 狅狆 犿 犲 犱 犻 犪 狋 犲 犱犻 狊 狅 狋 犺 犲 狉 犿 犪 犾犪 犿 狆犾 犻 犳 犻 犮 犪 狋 犻 狅 狀犿 犲 狋 犺 狅 犱 2 0 1 40 11 3 /G4C /G4D 2 0 1 40 80 1 /G4E /G4F /G21 /G22 /G23 /G24 /G25 /G26 /G27 /G27 /G28 /G29 /G2A /G2B /G2C /G2D /G2E /G2D /G2F /G30 /G31/G4C /G4D rHgCb@g · ykbûR60u5[PO –0SÑU.书书书前  言   本标准按照 G B/T1. 1—2 0 0 9给出的规则起草 。请注意本文件的某些内容可能涉及专利 。本文件的发布机构不承担识别这些专利的责任 。本标准由国家认证认可监督管理委员会提出并归口 。本标准起草单位 :中华人民共和国北京出入境检验检疫局 。本标准主要起草人 :魏海燕、曾静、马丹、张西萌、张蕾。 Ⅰ犛 犖/犜3 8 4 1—2 0 1 4 rHgCb@g · ykbûR60u5[PO –0SÑU.出口贝类中诺如病毒和星状病毒的快速检测 反转录环介导恒温核酸扩增(犚 犜  犔 犃犕犘 )法 1 范围 本标准规定了贝类中诺如病毒和星状病毒的反转录 环介导恒温核酸扩增 (RT  LAMP )快速检测法。本标准适用于贝类中诺如病毒和星状病毒的快速检测 。 2 规范性引用文件 下列文件对于本文件的应用是必不可少的 。凡是注日期的引用文件 ,仅注日期的版本适用于本文件。凡是不注日期的引用文件 ,其最新版本 (包括所有的修改单 )适用于本文件 。 G B/T6 6 8 2 分析实验室用水规格和试验方法 G B1 9 4 8 9  实验室 生物安全通用要求 G B/T2 7 4 0 3  实验室质量控制规范  食品分子生物学检测 S N/T1 6 3 5 贝类中诺沃克病毒检测方法  普通RT  P C R 方法和实时荧光 RT  P C R 方法 S N/T2 5 1 9 贝类中星状病毒检测方法  普通P C R和实时荧光 P C R方法 3 缩略语 下列缩略语适用于本文件 。 3.1 B e t a i n e:甜菜碱。 3.2 犅 狊 狋酶:犅 狊 狋DNApo lym e r a s e(l a rgef r agm e n t) ,犅 狊 狋DNA聚合酶(大片段) 。 3.3 d NT P:d e o xyr i b o n u c l e o s i d et r i ph o sph a t e,脱氧核苷三磷酸 。 3.4 LAMP:l o op m e d i a t e di s o t h e r m a la m pl i f i c a t i o n ,环介导恒温扩增 。 3.5 RNA:R i b o n u c l e i ca c i d ,核糖核酸 。 4 技术概要 利用G P TT法(G lyc i n e  P EG  T r i z o l  o l i god T)或纳米磁珠法提取贝类样品中的病毒 RNA;分别选取星状病毒衣壳蛋白编码基因 (OR F 2)5’端、GⅠ型和GⅡ型诺如病毒 OR F 1与OR F 2接头处的高度保守序列,设计5条~6条RT  LAMP 引物,特异性识别病毒 RNA上的7个~8个独立区域 ,在具有链置换作用的 犅 狊 狋酶、AMV反转录酶作用下 ,于等温条件 (6 3℃或6 5℃)保温6 0m i n,即可一步实现对病毒 RNA的高效扩增 。扩增反应产生大量副产物 (焦磷酸镁 )形成乳白色沉淀 ,在反应管中加入 S Y B RG r e e nⅠ荧光染料 ,阳极反应呈荧光绿色 ,而阴性反应为荧光橙色 。 5 试剂和材料 除有特殊说明外 ,所有实验用试剂均为分析纯 ;实验用水符合 G B/T6 6 8 2中一级水的要求 。 1犛 犖/犜3 8 4 1—2 0 1 4 rHgCb@g · ykbûR60u5[PO –0SÑU.5.1 引物:RT  LAMP 扩增引物序列见表 1,引物设计示意图参见附录 A。 表1 犚 犜  犔 犃犕犘 扩增引物 病毒名称 引物名称 序列(5’ 3’ ) 星状病毒外侧上游引物 (A s t  F 3)G CAGGTAAC TGTTGAGGT CA 外侧下游引物 (A s t  B 3)GGTTTTGGT C C TGTGACAC C 内侧上游引物 (A s t  F I P )C TG C T C TGT C C C G C C C T C TAATGG C C G CAACAGGAGTA 内侧下游引物 (A s t  B I P )AGGAC TAGAAGACAG C C C GGATGACAATGTTAC GGACAC GT 环状上游引物 (A s t  L F)TTGTGAG C GGG C C C TTG 环状下游引物 (A s t  L B)C G C GG CAAACAT CAAT C TT C T CA GⅠ型诺如病毒外侧上游引物 (GⅠ F 3)T C TACATT C C TGGGTGG CA 外侧下游引物 (GⅠ B 3)C C CAG C TAC TGGTT C CATTG 内侧上游引物 (GⅠ F I P)AGGAGAT C G C GAT C C C C TGT C C CATGTT C C G C TGGATG C 内侧下游引物 (GⅠ B I P)G C GT C TAAGGAC G C C C CAAC GG C T CAG C TGTATTTG C C T 环状上游引物 (GⅠ L F)ACATG C T CAGAT CATGGAAG C GⅡ型诺如病毒外侧上游引物 (GⅡ F 3)G C C C CAAC CATGAAGAC C 外侧下游引物 (GⅡ B 3)AC GTG C T CAGAT C C GAGAA 内侧上游引物 (GⅡ F I P)GAATG C TGGG C C GTGGAGTGTGATAC CACAC T C C CAGAGG 内侧下游引物 (GⅡ B I P)TG CAGAGTTGAAGGAAGGTGG C C CAT C TGAACAT C GG C T C TT 环状上游引物 (GⅡ L F)C CAT CAAAGACAT CAATTGTATGGG   注:RT  LAMP 引物的设计分别参照 1型星状病毒 P u n e/0 6 3 6 8 1/I n d i a毒株的衣壳蛋白编码基因 (OR F 2)5’端核 酸高度保守序列 (a c c e s s i o nN o. J F 3 2 7 6 6 6 ) 、GⅠ型和GⅡ型诺如病毒 OR F 1与OR F 2接头处高度保守序列 (GⅠ型诺如病毒 a c c e s s i o nN o. U 0 4 4 6 9 ,GⅡ型诺如病毒 a c c e s s i o nN o. X 8 6 5 5 7 ) 。 5.2 AMV反转录酶 :1 0U/μL。 5.3 d NT P:1 0mm o l /L。 5.4 犅 狊 狋酶:8U/μL。 5.5 1 0×T h e r m o P o l 缓冲液:含2 0 0mm o l /LT r i s  HC l (pH8. 8) 、1 0 0mm o l /L(NH4)2S O4、1 0 0mm o l /LK C l、2 0mm o l /L,MgS O4、1%T r i t o nX  1 0 0 。 5.6 MgS O4:5 0mm o l /L。 5.7 甜菜碱:5m o l/L。 5.8 显色液:浓度为10 0 0×S Y B RG r e e n Ⅰ。 5.9 阳性对照 :GⅠ型诺如病毒 /GⅡ型诺如病毒 /星状病毒阳性样本由具备相关资质的实验室提供 ,添加于已知的阴性贝类样品中 ,制成阳性质控样品 ;也可选用含扩增目的基因的体外转录 RNA分子(经荧光RT  P C R 验证,紫外分光光度计进行定量后 ,稀释成1 0 0拷贝/μL,分装成小份冻存于 -8 0℃,避免反复冻融 ,保存期限可达一年 )作为RT  LAMP 扩增时的阳性对照 ,病毒目的基因序列参见附录 A。 6 仪器和设备 6.1 移液器:量程分别为 0. 5μL~1 0μL、1 0μL~1 0 0μL、1 0 0μL~10

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